Морското училище е с богати традиции, които водят началото си от XIX век. Те включват съчетаването на теоретичното обучение с практиката, възпитанието в дух на дисциплина, екипност и любов към морето. Не на последно място е уважението към ветераните и преподавателите на флотската алма-матер, външен израз на което е отдаването на почести пред паметника на патрона на ВВМУ – Никола Вапцаров, и провеждането на военен ритуал пред Алеята на преподавателя.
Основни принципи в Училището са:
- Институция за обучение на морски начин на живот;
- Едновременно обучение на командни кадри за военния и гражданския флот;
- Органично съчетаване на теорията с практиката;
- Център за морско образование и наука в България;
- Спазване на морските стандарти за обучение на морски кадри.